从实体到概念始基，从静到动的哲学转变

继米利都学派之后，南意大利的毕达哥拉斯（约公元前580－前500）学派和爱非斯赫拉克利特（约公元前540－前470）的哲学思想问世。

毕达哥拉斯学派和赫拉克利特，在自然观上进一步发展了米利都学派的思想。毕派把“数”，赫拉克利特把“火”看成万物的“始基”、“本源”。毕派把全部时间用在对数学的研究上，进而认为数学的本原就是万物的本质。由于在这些本原中数目是基本的……这些哲学家显然是把数目看作本原……。而赫拉克利特则明确指出：“这个世界，对于一切存在物都是一样的，它不是任何神所创造的，也不是任何人所创造的，它过去、现在、未来永远是一团永恒的活火，在一定的分寸上燃烧，在一定的分寸上熄灭”。毕派继米利都学派之后，进一步用数，这个有限的本原说明世界。“数”在毕派那里是不脱离具体事物的。它反映着事物的不同的具体属性、特征。用具体事物的有限的数量关系去规定世界万物的本原，比起来利都学派那种具体、无限的“始基”、“本原”，显然，它表明了人类意识的进步。赫在毕派之后，用“火”说明世界的本原，和毕派一样，也反映了人类意识的这种进步。赫的本原“火”从本质上看正如柏拉图所肯定的：“唯有自身运动，而又不失去自己，永远不会停止运动，而对那些运动的东西来说，则是源泉和始基”。

尽管如上面所说，他们的思想标志着人类意识新的进步，但无论毕派还是赫拉克利特的思想仍然残留着原始宗教思想的尾巴。毕达哥拉斯认为“人有灵魂”，传说他是第一个发现灵魂轮回的人，他宣称：“灵魂依命运的规定，从一个生物体转到另一个生物体中”。由此出发，他把社会看成是“按神的意志组织的一切”。而赫拉利特，则把灵魂看成是火，并且也承认神的存在。他讲“最智慧的人同神相比，无论在智慧、美丽、或其它方面，都象一只猴子”，“在神看来是幼稚的，正如成人看来儿童是幼稚的”。

无疑，毕派和赫拉克利特在创立自己学说的同时，仍在和传统的宗教观念进行着斗争。然而，要想彻底摆脱传统宗教的思想束缚，首要前提是区分开思维与存在，自觉的确立起主体与客体的对立关系、因为，只有在对立与区别之中，才能谈得上人类理性认识自己、解放自己，虽然毕派和赫拉克利特还没有完成和实现这一目标，但他们的思想，却明显地反映出朝这个方向所做的努力，把灵魂看成可以离开肉体轮回，把灵魂等同于火，这分明是看出了物质与精神的明显差别，正是这些思想萌芽，才结出了后来那些自觉、成熟的思想之果。